MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 7459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009712	TTA	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009712	TTTC	2	8	81	88	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009712	AGA	2	6	134	139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009712	GGA	2	6	174	179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009712	TAAAAA	2	12	190	201	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009712	GTAC	2	8	295	302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009712	T	6	6	303	308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009712	TC	3	6	311	316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009712	GCC	2	6	3305	3310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009712	ACA	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009712	TCT	2	6	3367	3372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009712	CATT	2	8	7627	7634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009712	GGA	2	6	8407	8412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009712	AACCGG	2	12	8415	8426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009712	GAA	2	6	9873	9878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009712	TCA	2	6	10409	10414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009712	GGA	2	6	11926	11931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009712	A	6	6	12804	12809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009712	CTGA	2	8	14794	14801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009712	AAC	3	9	15467	15475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009712	AAT	2	6	15512	15517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009712	GTC	2	6	15528	15533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009712	CT	3	6	17799	17804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009712	TTTCA	2	10	17815	17824	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009712	T	6	6	17847	17852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009712	TCC	2	6	17866	17871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009712	ACA	2	6	17946	17951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009712	A	6	6	17971	17976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009712	TATGG	2	10	20074	20083	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009712	ATC	2	6	20350	20355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009712	TG	3	6	20401	20406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009712	AGA	2	6	20419	20424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009712	GGCC	2	8	20492	20499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009712	TAA	2	6	20523	20528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009712	T	9	9	25673	25681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009712	GTATA	2	10	26259	26268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009712	TTA	2	6	26310	26315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009712	TCT	2	6	26383	26388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009712	ATT	2	6	26416	26421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009712	CCT	2	6	26433	26438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009712	CTC	2	6	26569	26574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009712	T	8	8	26582	26589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009712	AGGGGG	2	12	26624	26635	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009712	C	7	7	26645	26651	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_009712	ACC	2	6	26652	26657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009712	GC	3	6	26697	26702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009712	CGA	2	6	26717	26722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009712	G	12	12	26754	26765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009712	C	8	8	26775	26782	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_009712	G	7	7	26799	26805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009712	TCC	2	6	26813	26818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_009712	AAG	2	6	26828	26833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009712	G	6	6	26837	26842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009712	CGGGC	2	10	26876	26885	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009712	G	8	8	27363	27370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009712	AAG	2	6	27918	27923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009712	GCC	2	6	27938	27943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009712	CGGGA	2	10	27992	28001	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009712	GGA	2	6	28037	28042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009712	A	6	6	28074	28079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009712	TA	4	8	28100	28107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009712	ATC	2	6	28135	28140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009712	ATT	2	6	28336	28341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009712	T	6	6	28340	28345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009712	T	7	7	28347	28353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009712	ATTC	2	8	28356	28363	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009712	GTA	2	6	28407	28412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009712	A	9	9	28417	28425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009712	AT	3	6	28456	28461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009712	A	6	6	32373	32378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009712	CT	3	6	32433	32438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009712	A	6	6	33095	33100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009712	AAC	2	6	33120	33125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009712	CTGC	2	8	34114	34121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_009712	TGG	2	6	34125	34130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009712	GCG	2	6	35241	35246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009712	A	6	6	35250	35255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009712	T	7	7	35265	35271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009712	AC	3	6	35685	35690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009712	CCCT	2	8	36799	36806	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_009712	AAT	2	6	38389	38394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009712	TGTT	2	8	38411	38418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009712	T	7	7	39708	39714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009712	T	6	6	39741	39746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009712	CGGA	2	8	41460	41467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009712	ACC	2	6	41492	41497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009712	TA	3	6	41506	41511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009712	CCT	2	6	41527	41532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009712	TCC	2	6	41929	41934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009712	ACA	2	6	41953	41958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009712	GTT	2	6	44069	44074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009712	CAA	2	6	44706	44711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009712	A	6	6	46254	46259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009712	T	7	7	46268	46274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009712	TC	3	6	46317	46322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009712	A	6	6	46335	46340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009712	A	7	7	46344	46350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009712	A	7	7	46362	46368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009712	TA	3	6	46798	46803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009712	GAT	2	6	48448	48453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009712	T	9	9	50035	50043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009712	TAA	2	6	50100	50105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009712	T	6	6	51658	51663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009712	ACA	2	6	56525	56530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009712	TA	3	6	56547	56552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009712	AAC	2	6	56567	56572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009712	T	6	6	57944	57949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009712	A	8	8	59066	59073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009712	ATTC	2	8	59678	59685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009712	T	9	9	59690	59698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009712	C	6	6	61647	61652	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_009712	TAAT	2	8	61664	61671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009712	TA	3	6	61685	61690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009712	TGCGA	2	10	61758	61767	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009712	GA	3	6	61865	61870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009712	T	7	7	62774	62780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009712	GCC	2	6	62814	62819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_009712	AGGA	2	8	62859	62866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009712	ATT	2	6	64396	64401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009712	T	7	7	66433	66439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009712	CGC	2	6	66443	66448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009712	AG	3	6	66485	66490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009712	CCT	2	6	66953	66958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009712	CCGG	2	8	66975	66982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009712	TAT	2	6	66991	66996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009712	TGCGA	2	10	67021	67030	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009712	AGC	2	6	67082	67087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009712	CCA	2	6	67106	67111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_009712	T	6	6	68011	68016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009712	CGG	2	6	68025	68030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009712	A	6	6	68041	68046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009712	T	9	9	69117	69125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009712	GAT	2	6	70378	70383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009712	GTGA	2	8	70395	70402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009712	TCT	2	6	70433	70438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009712	TCC	2	6	70498	70503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_009712	AATC	2	8	70510	70517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009712	CTGC	2	8	70528	70535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009712	CTG	2	6	71105	71110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009712	CCG	2	6	71162	71167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009712	CCGG	2	8	71255	71262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009712	CTC	2	6	71289	71294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_009712	GCTC	2	8	71327	71334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_009712	AC	3	6	71367	71372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009712	TATCA	2	10	71446	71455	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009712	AT	4	8	71459	71466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009712	T	7	7	71548	71554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009712	GTA	2	6	72921	72926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009712	GGCC	2	8	72983	72990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009712	GAA	2	6	73005	73010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_009712	T	7	7	123316	123322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_009712	GCT	2	6	123364	123369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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